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FastQC安装与质检

FastQC安装与质检

作者: PriscillaBai | 来源:发表于2019-06-02 14:34 被阅读0次

在官方网站下载 FastQC v0.11.8 (Win/Linux zip file)
http://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/download.html#fastqc

将下载完的文件塞到你的目标文件夹中,打开终端,配置环境变量,这样你就能在任何一个文件夹下运行fastqc

echo "export PATH=$PATH:/Users/baiyunfan/bio/FastQC" >> ~/.bashrc
source ~/.bashrc

然后cd到你放数据的文件夹下

fastqc SRR2060752.fastq

会生成报告

报告的结果可在如下博客解读:
https://blog.csdn.net/gateswell/article/details/78858579

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