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2022空间转录组分析01：stLearn CCI分析教程数据说

2022空间转录组分析01：stLearn CCI分析教程数据说

作者: 信你个鬼 | 来源:发表于2022-02-22 12:05 被阅读0次

教程链接：https://stlearn.readthedocs.io/en/latest/tutorials/stLearn-CCI.html

教程更新速度太快，很多网络上的帖子已经不能运行了，官网教程的数据又没有提前交代。。。还没开始学习就遇到了两个坑。。。
此教程数据在：10X官网

image-20220222115359259.png image-20220222115542672.png

space ranger 1.1.0与1.0.0区别：spot数不一样，官方教程采用的是1.0.0，V1_Breast_Cancer_Block_A_Section_1/的spot数为3813个

image-20220222115721000.png

教程中的label_transfer_bc.txt数据在：https://github.com/BiomedicalMachineLearning/stLearn/tree/master/tutorials

关于label的来源，可见：https://github.com/BiomedicalMachineLearning/stLearn/issues

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    本文链接：https://www.haomeiwen.com/subject/odkglrtx.html

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