0.ref
https://doi.org/10.1186/s12864-019-5470-2
https://www.cs.cityu.edu.hk/~shuaicli/SuperRec/
wget https://www.cs.cityu.edu.hk/\~shuaicli/SuperRec/SuperRec.tar.gz
tar -zxvf SuperRec.tar.gz
mv program SuperRec
cd SuperRec && ./SuperRec
结果预览：
用到的输入数据是HiC-Pro的输出结果
这里我们使用1 Mb的分辨率, 仅保留染色体的互作信息, 删除所有scaffold的信息
输入文件有二：
一个是iced.matrix(稀疏矩阵)；
另一个是abs.bed；
carm.1MB.iced.matrix
carm.10k.abs.bed
输入文件如图
2.运行SuperRec - 某条染色体的三维结构重建
#提取指定染色体的互作信息，这里略
#我比较关心全基因组的三维结构重建
./SuperRec carm.1MB.iced.matrix -o carm.1MB
3.运行SuperRec - 全基因组的三维结构重建
相比单条染色体，多了一个参数
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