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TCGA下载相关资料(update-1/3)

TCGA下载相关资料(update-1/3)

作者: caokai001 | 来源:发表于2020-01-03 16:24 被阅读0次

5.ICGC数据库如何下载癌症数据

2019年12月21日11:55:18

4.一文搞懂TCGA中的分析结果如何来

介绍TCGA数据库结果，如何处理得到的。

3.MAF格式及其TCGA样本编号

  • MAF:Mutation Annotation Format格式简介

    Annotated Somatic Mutation, 体细胞突变的注释文件，格式为VCF, 采用VEP软件进行注释，文件后缀为vep.vcf.gz
    Raw Simple Somatic Mutation, 体细胞突变的原始文件，格式为VCF, 文件后缀为vcf.gz
    Aggregated Somatic Mutation, protected的突变注释文件，需要账号和权限才可以下载，格式为MAF, 文件后缀为maf.gz
    Masked Somatic Mutation, open access的突变注释文件，免费下载的，格式为MAF, 文件后缀为maf.gz

  • TCGA癌症类型和样本代号解析

    image.png

2.知乎专栏 zeroing

1.百味科研芝士

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