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位点特异矩阵

位点特异矩阵

作者: 纵春水东流 | 来源:发表于2021-04-08 11:37 被阅读0次

1.简要说明
位点特异矩阵(position weight matrix ,PWM), 或者位置特异矩阵(position-specific weight matrix ,PSWM )或者 位置特异打分矩阵(position-specific scoring matrix ,PSSM), 通常用于计算基序motif。

1.1PWM
通过功能相关序列比对可以得到PWMs,同时也用于很多软件来发现motif

1.2背景
位点特异矩阵是1982年由美国遗传学家Gary Stormo和其同事开发的,作为一种计算保守序列的替代工具....

1.3使用保守相似的序列计算位点概率矩阵

翻译至:https://en.wikipedia.org/wiki/Position_weight_matrix

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