基因组学了一个月了，自学进展真的很慢。
首先我刚刚接触生信，linux集群，conda，这都是我这个月才真正知道并且实操的。还要找人开通权限，需要什么软件，上网找安装软件教程，如果安不明白还要找其他的教程......
我知道前人有写过非常好的教程，但是多数需要一些基础，或者会遇到各种不一样的问题。比如一般在linux安装软件就是要下压缩包，解压，./configure，make或者make all。还有的软件可能解压就能用，还有的软件比如repeatmasker就要安装好多附属的搜索引擎和库。还有一些error就也要去搜怎么处理...
我这几天安装的软件 还没安完 如果别人有 就用别人的吧...
还有一些基础知识就是 bash文件里可以添加PATH，个人觉得是像windows桌面快捷方式一样的东西。
然后还有一件重要的事就是，从别人那拿来的结果，然后进行后续分析的话，有条件的还是最好先看手上的资料是什么，怎么来的，用了什么分析，数据质量，总量，都最好问明白，因为我这两天要交一个课程作业，写材料方法，写结果的时候什么都写不出来都是自己查或者猜测，之前人做的图也不好看要重新做但是手头数据又不足，还得去跟人家要数据...总之就是社恐噩梦了...
需要了解的事：用什么方法测序的（一种还是多种），下机数据得到了多少reads（下机数据质量），用什么软件组装的，组装了多少数据（组装的质量），基因组基本信息（GC值，甲基化，假定染色体，同源）（就是那个圈图）。注释怎么选择参考基因组，
基因组预测 用k-mer分析进行基因组调查：（四）用GenomeScope评估基因组特征+用Smudgeplot估计倍性 | 生信技工 (yanzhongsino.github.io)
基因组注释 基因组注释（一）：重复序列注释 | 生信技工 (yanzhongsino.github.io)
哦有一个小tips从别人那学来的，就是文件夹或者脚本的名字，可以在最前面编上号码，01,02什么的，这样tab的时候很好用，还有就是文件夹名字不要有空格，会报错（来自纯新手的告诫）
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