配置文件语法（续）
4 动态执行参数
在配置文件中，通常以如下方式设置一个常量
variable = value
例如
color = blue
但是，有时候，你可能想用另一个参数的值或函数来指定配置参数的值。
4.1 访问配置参数的值
可以使用语法将一个参数的值赋值给另一个参数
parameter2 = conf(parameter1)
或者，用指定块内的参数赋值
parameter2 = conf(block1,parameter1)
parameter2 = conf(block1,block2,parameter1)
...
举个例子
<plots>
show_histogram = yes
<plot>
show = conf(plots,show_histogram)
type = histogram
...
在解析配置文件的时候，会将所有 conf(parameter) 替换成对应的 parameter 的值
使用这个语法时，需要确保包含参数的完整块路径，如
<block1>
<block2>
parameter1 = ...
</block2>
</block1>
要使用 conf(block1,block2,parameter1) 获取对应的值
如果你想要在当前块引用参数并向上层进行搜索，可以用 . 代表路径
<plots>
<plot>
type = histogram
r0 = 0.5r
r1 = conf(.,r0)+50p
...
这种方式在 rules 中非常有用
<plots>
<plot>
x = 10
...
<rules>
<rule>
# x 没有在这个块中定义，但是会
# 在外面的块中搜索
condition = conf(.,x) == 10
...
4.2 访问数据属性
在 <rules> 中，可以用 var() 函数来获取数据点属性，如位置或者值等信息
<rule>
COLOR = var(ID)
4.3 对参数执行操作
任何参数都可以编写为 Perl 代码并在运行时执行
但是必须将参数写在 eval 函数内
thickness = eval(1+1)
color = eval("b"."l"."u"."e")
eval 函数能够非常方便的推断和操作其他配置文件中的参数
track_color = blue
track_width = 100
track_start = 0.5
<plots>
<plot>
# color=blue
color = conf(track_color)
# r0 = 0.5r
r0 = eval(conf(track_start) . "r")
# r1 = 0.5r+100p
r1 = eval(conf(track_start) . "r" + conf(track_width) . "p")
</plot>
</plots>
conf(track_color) 会做简单的替换，并不需要使用 eval 函数，如果你要对参数值进行操作，不需保证 eval 函数内的表达式是一个有效的可执行代码
因为 eval 参数需要书写正确的 perl 语法，因此错误率很高
注意：最常犯的错是忘记加引号
## OK
x = eval( 1.05 . "r" )
## NOT OK，perl 会将 r 作为一个裸词，引发错误
x = eval( 1.05 . r )
覆盖值
上面已经提到过，通常，只有少数参数能够设置多个实例，大多数参数都不支持多个实例
那如何覆盖原来的值呢？
<ideogram>
position = 0.9r
position* = 0.8r # this value will be used
...
</ideogram>
通过在参数名称添加后缀 *，将会用新值来覆盖原来定义的值
你可以在参数名后面添加任意多的 *，而参数最后的值是 * 最多的那次的赋值
5 字体
字体文件在 fonts 文件夹下
light = fonts/modern/cmunbmr.otf # CMUBright-Roman
normal = fonts/modern/cmunbmr.otf # CMUBright-Roman
default = fonts/modern/cmunbmr.otf # CMUBright-Roman
semibold = fonts/modern/cmunbsr.otf # CMUBright-Semibold
bold = fonts/modern/cmunbbx.otf # CMUBright-Bold
italic = fonts/modern/cmunbmo.otf # CMUBright-Oblique
bolditalic = fonts/modern/cmunbxo.otf # CMUBright-BoldOblique
italicbold = fonts/modern/cmunbxo.otf # CMUBright-BoldOblique
如果要设置自己的字体，可以将你的字体 TTF 文件拷贝到 fonts 文件夹下，然后在 fonts.conf 配置文件中引入
6 单位
配置文件中定义的许多参数都需要单位
-
b(base)- 表示距离 -
p(pixels)- 像素大小：轨迹半径，标签大小，字形大小 -
r(relative)- 相对量，比如label radial padding相对于label width的大小 -
u(chromosome units)- -
n (no unit)- 无单位值的显式后缀
有后缀的值可以混合使用
# 1 pixel padding
padding = 1p
# relative padding (e.g. relative to label width)
padding = -0.25r
# radius of track (relative to inner ideogram radius)
r0 = 0.5r
# combination of relative and pixel values
r1 = 0.5r+200p
（未完，待再续......）
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