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小记:关于网络分析

小记:关于网络分析

作者: 赵会成 | 来源:发表于2019-03-15 14:44 被阅读0次

生态网络研究就是利用网络理论,在群落水平上研究不同物种间相互作用的规律和模式。

节点 (node):生态网络中的物种,也可叫

做顶点(vertex)

连接 (link):用于展示物种之间的联系,也

叫边(edge)

度(degree):某节点连接其它节点的个数

路径(path):从一个节点到达另一个节

点所需要通过的所有 节点

网络分析可能是鉴定未知分类群落生态作用的有效工具

由于大多数微生物类群难以培养,因此网络分析可能突出了难以直接观察的生物的生态策略。

例如,这些与已知生态作用的分类群有着强烈共发生作用的分类群,可能起着类似的生态作用。

整个细菌群落在系统发生上成簇,这意味着环境过滤可能对细菌群落结构重要。

有的细菌虽然相对丰度较低,但具有较高的网络中心性。这一点备注一下,观察下自己的数据。

做一个表格

给出三种土地利用方式下网络的网络结构统计以及10000个随机网络的平均值和标准偏差值a,z分数量化给定网络统计高于或低于随机生成的网络的标准偏差的数量b

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community and network structure

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