了解物种详细名称,具体分析内容。 0.prodigal 注意多个contig的genomecds和pep:的loc...
功能注释 需要faa蛋白序列,prodigal的pep就是蛋白序列 1.BLAST数据库注释 1. blast 需...
1.conda安装 直接安装 2.手动安装 2.1 Celera assembler 界面似乎提醒已经停止更新,如...
细菌基因组组装金标准:GAGE-B 组装软件的选择 细菌基因组组装的目标不同于大型生物基因组的组装,大型基因组组装...
甲基化修饰 甲基化分析结果(直接从服务器下载,文件名乱码)/opt/pacbio_soft/smrtanalysi...
2.7.1 mummer共线性分析 mummerlink 代码参考(输出文件为默认的out.delta) plot...
一、软件介绍: 1、文章信息: Petit III RA, Read TD,Bactopia: a flexibl...
导读 BPGA是Bacterial Pan Genome Analysis tool的简写,16年发表的工具,17...
1.组装 小基因组比如细菌的(不到10M)可以直接用HGAP3。直接在网页版跑,(<100M)都可以。 端口配置。...
一个细菌基因组完整分析脚本https://mp.weixin.qq.com/s/J4j_-XnEDu0S7k5Vd...
本文标题:细菌基因组分析记录
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