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DAY5 R——两大数据类型:向量和数据框

DAY5 R——两大数据类型:向量和数据框

作者: 喜喜66 | 来源:发表于2019-03-10 14:49 被阅读67次

一. 向量

  • 向量,元素,标量区别
    图引自生信星球
    image.png
  • 赋值
    给变量定义就是赋值, 注意以最后一次为准!注意以下常用表达
    x<-c(1,2,3) #常用的向量定义写法,意为将x定义为由元素1,2,3组成的向量。
    x<-(1:10) #从1-10之间所有的整数
    x<-seq(1,10,by = 0.5)#1-10之间每隔0.5取一个数(注意这里是逗号不是分号)
    x<-rep(1:3,times=2) #1-3 重复2次
  • 从向量中提取元素
    1.根据元素位置
    这里的x是你刚才赋值的变量名,根据自己的情况来修改
    x[4] #x第4个元素
    x[-4]#排除法,除了第4个元素之外剩余的元素
    x[2:4]#第2到4个元素
    x[-(2:4)]#除了……
    x[c(1,5)]#第1个和第5个元素
    2.根据值的大小
    x[x==10]#等于10的元素
    x[x<0]
    x[x %in% c(1,2,5)]#存在于向量c(1,2,5)中的元素

二. 数据框

  • 练习时先将doudou.txt和huahua.txt数据放在RData文件夹下
  • 读取本地数据
    read.table(file = "huahua.txt",sep = "\t",header =T) #读取文件,分隔符为Tab(点tab键可以出来seq),有表头
    a<-read.table(file = "huahua.txt",sep = "\t",header =T)#把这个数据框赋给一个变量a
  • 设置行名和列名
    X<-read.csv('doudou.txt') #在示例数据里有doudou.txt 注意这里的变量X是一个数据框
    colnames(X) #查看列名
    rownames(X)#查看行名,默认值的行名就是行号,1.2.3.4...
    colnames(X)[1]<-"bioplanet"#有的公司返回数据,左上角第一格为空,R会自动补为x,用这个命令来修改
    X<-read.csv(file = "huahua.txt",sep = "\t",header =T,row.names=1)#最后row.names的意思是修改第一列为行名
    撤销吗: 用刚才的read.table命令重新赋值一遍就可以覆盖了."变"量看最后一次!)
  • 数据框的导出
    write.table(X,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F)#其中sep = ","是分隔符改为逗号,quote=F表示字符串不加双引号(默认格式带有双引号) ,而quote函数如果为TRUE的话则表示要带双引号,如果是FALSE,就像这里的quote=F表示不加双引
  • 变量的保存与重新加载
    保存的格式是RData。
    save.image(file="bioinfoplanet.RData")#保存当前所有变量
    save(frame1,file="frame1.RData")#保存其中一个变量
    load("frame1.RData")#再次使用RData时的加载命令
  • 提取元素
    这里的X是指的我用过的一个变量名,实际应用要懂得替换。刚才让师姐测试我教程的时候很担忧你们粗暴地复制我的代码,最后啥也没看懂。
    X[x,y]#第x行第y列
    X[x,]#第x行
    X[,y]#第y列(横着写)
    X[y] #第y列(竖着写)
    image.png
    X[a:b]#第a列到第b列
    X[c(a,b)]#第a列和第b列
    X$列名#也可以提取列(并且支持Tab自动补全,不过只能提取一列,优秀写法)
  • 直接使用数据框中的变量
    比如要取提取列名case和values的为某两列作散点图:
    1. 方法1
    c <-data.frame(case=paste("S",c(1:50)),values=runif(50)) 这里的paste是拼接字符串的函数
    plot(c$case,c$values)
    但这里说这里这种方法有个缺点:数据框名a在代码中重复出现(此处试验了下没有)
    2. 方法2(这种方法数据框名a在代码中就不重复出现了)
    with(c,{
    + plot(case,values)
    x<<-summary(values) #求和并赋值给x,<<的意思是作为全局变量,也就是出了with循环仍有效。
    })
    什么是with循环? 如下百度感觉很形象
    image.png
    全局变量含义?
    函数内部的变量通常为局部变量,可以通过 <<- 赋值,成为全局变量,这样就可以在其他函数中被调用。

三.其他注意TIP

  • 脚本窗口使用
    新建脚本,并在里面打代码/粘贴大神代码。然后保存到RDATA工作目录下,打开,注意脚本文件的后缀就是R

    image.png
  • 在哪看变量
    引自生信星球

    image.png
  • 其他潜意识小tip
    来自生信星球的大神总结
    (1)R的赋值符号不是等号,而是<-
    (2)在Console 控制台输入命令,相当于Linux的命令行
    (3)R的代码都是带括号的,括号必须是英文的。
    (4)显示工作路径 getwd()
      设置工作路径setwd("C:/Users/kingjie/Desktop/Rdata")
    (5)向量是由元素组成的,元素可以是数字或者字符串。
    (6)表格在R语言中改名叫数据框_
    (7)别只复制代码,要理解其中的命令、函数的意思。函数或者命令不会用时,除了百度/谷歌搜索以外,用这个命令查看帮助:?read.table,调出对应的帮助文档,翻到example部分研究一下。
    (8)数据类型(两重点)
    向量(vector),矩阵(Matrix),数组(Array),数据框(Data frame),List

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