如何在linux中安装软件

1. 什么是conda?

Conda 是一个开源的软件包管理系统和环境管理系统，用于安装多个版本的软件包及其依赖关系，并在它们之间轻松切换。
Conda 是为Python程序创建的，适用于 Linux，OS X 和Windows，也可以打包和分发其他软件。

2. 下载conda（miniconda是conda的精华版）

百度/谷歌搜索“miniconda 清华”（是清华的conda镜像网站）

找到与服务器匹配的版本（要先用uname -a 命令查看服务器是多少位的）

复制下载链接

登录服务器，用 wget 命令 + 下载链接（这里不仅要粘上下载链接，还有路径也要有的，否则就像下图）

错误的.png

这样才是正确的下载成功界面

正确的.png

3. 安装miniconda

用 bash 命令进行安装，即bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh

image.png

根据提示进行，每一步操作，要继续按enter键，或yes或no

安装成功.png

4. 激活conda

用source ~/.bashrc 来激活
然后命令行输入conda，出现满屏的信息说明成功了

激活成功.png

5. 开始使用conda

查看当前服务器上安装的所有软件列表 conda list
搜索conda软件 conda search fastqc
镜像未配置好，出现失败
搜索失败.png
重新配置镜像，在进行搜索就可以了

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
conda config --set show_channel_urls yes
全选复制粘贴回车

重新配置镜像后成功搜索.png