数量遗传学5-哈代温伯格定律拓展

先来一道题

求等位基因A的频率
A表现型频率：
AA、AO基因型个数：
模拟群体繁殖过程，进行迭代：
模拟数字证明，基因频率不变

影响哈代温伯格的四个条件：

Mutation突变
Selection选择
Migration迁移
Drift漂变

突变

短期内不用考虑，snp位点太多了，对家畜的进化和生产上的一些重大变化具有重要意义

Selection选择

如果一个基因的适应度w大于平均适应度，这个基因频率在逐渐增大
如果是等于的话，说明没有选择作用

Drift漂变--有点复杂这玩意

*拷贝数就是在基因组中的数量

遗传漂变5个特点：
1.漂变是无偏好的
2.小种群中等位基因的随机波动更强烈
3.漂变让遗传多样性丢失，当等位基因的频率等于0或者1时，就是我们说的被固定了
4.漂变会让原来一样的种群朝着不同方向发展
5.一个等位基因在没有自然选择的情况下也可以被固定，有点打脸达尔文进化论

选择和漂变的关系

如果选择的强度相对于漂移的影响较弱，那么漂移将克服选择的方向性影响
假设基因型AA: AA: AA的适合度为1 + 2s: 1 + s: 1

木村提出的固定概率
N-种群数 s-优势基因的选择指数 p-基因起始频率
针对上面公式，如果4Ns >> 1，等位基因A有很高的固定概率，然而，1 - U(p)总是非零的，这意味着A总是有可能丢失，值得注意的是新的突变

(即。， p = 1/(2N))，即使是在非常有利的情况下，通常也会因漂移而丢失，如果4 n | | < < 1,那么U (p)≅p所以选择性中性等位基因的行为。

连锁不平衡

近亲繁殖增加了纯合基因型的比例
远系繁殖增加了杂合基因型的比例
然而，单靠近交或远交并不会改变基因频率，涉及到连锁平衡的问题

连锁平衡：等位基因是独立的Pr(AB) = Pr(A) x Pr(B)
连锁不平衡：D = Pr(AB) - Pr(A) x Pr(B)
D如果为正。说明AB基因频率比预期要大。

连锁不平衡的衰变

r是重组概率

不断迭代后，得到不均衡指数
这个指数是在不断的减小的