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R中核酸序列的反向和互补

R中核酸序列的反向和互补

作者: 董八七 | 来源:发表于2018-09-30 18:06 被阅读3次

在R中读入序列,并得到反向、互补或反向互补序列。

library("Biostrings")
library(tidyverse)
fastaFile <- readDNAStringSet("my.fasta")
# 或
dna <- DNAStringSet(c("ATCTCGGCGCGCATCGCGTACGCTACTAGC",)
# 反向
dna  %>% reverse
# 互补
dna  %>% complement
# 反向互补
dna  %>% reverse %>% complement

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