https://github.com/tpoorten/dotPlotly
这个链接还有一些基因组比对的基本内容
https://github.com/tangerzhang/GenomicsPracticeData
dotPlotly 是两个R 脚本的项目,可以用来画PAF format (minimap2 比对软件的默认输出格...
1.目的 使用 dotPlotly 可视化 minimap2 或者 mummer 得到的序列比对结果。 2.安装 ...
pafr包的参考链接 https://cran.r-project.org/web/packages/pafr/v...
最近进行基因组共线性分析,基因组比较大,利用nucmer比对报内存,改用minimap2进行比对分析,进行可视化发...
Minimap2是知名比对工具BWA的开发者Li Heng新开发的比对工具,它能够快速的将DNA或者mRNA序列比...
文件格式如下: 附带R脚本:
使用minimap2将三代数据比对到基因组,再使用racon纠错。做3次。 一、软件安装 minimap2安装:直...
https://alvis.readthedocs.io/en/latest/usage/usage.html[h...
老规矩,先和同学们介绍一下为什么要做这么一款软件?基因组比对paf格式文件: 当同学们需要进行基因组层面的序列比较...
Minimap2是李恒大牛在2018年开发的针对于三代测序数据进行比对的工具,minimap2的优势是速度快,而且...
本文标题:可视化minimap2比对paf格式的R脚本
本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/sdivydtx.html
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