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Vcftools --minDP 根据depth过滤

Vcftools --minDP 根据depth过滤

作者: 杨康chin | 来源:发表于2022-01-18 19:45 被阅读0次
vcftools --vcf test.vcf --minDP 6 --recode --recode-INFO-all --out test.depth6

只得到depth大于等于6的个体的位点,其他的都被写成./. missing data了。

冒号分割的第三列是depth(DP)

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