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【生信知识】---CNV识别软件评测专题(二)

【生信知识】---CNV识别软件评测专题(二)

作者: 卡布达b1 | 来源:发表于2020-04-30 14:24 被阅读0次

前言:CNV识别软件评测专题(一)指路👉www.jianshu.com/p/ca856b55e6bf

2.PennCNV2
编程语言: C++
发表杂志:Bioinformatics
官方网站:http://penncnv2.openbioinformatics.org/en/latest/
软件原理:

软件安装:
1.下载软件

git clone https://github.com/WGLab/PennCNV2.git

2.配置环境:

GNU C compiler (gcc/g++)
GNU scientific library (http://www.gnu.org/software/gsl/)
Boost C++ libraries (http://www.boost.org)

3.配置locations.mk文件:

BOOST_INC_FLAGS = -I/home/kaiwang/usr/boost/boost_1_58_0/
BOOST_LIB_FLAGS = -L/home/kaiwang/usr/boost/boost/lib

GSL_INC_FLAGS = -I/home/kaiwang/usr/gsl/gsl/include
GSL_LIB_FLAGS = -lgsl -lgslcblas -L/home/kaiwang/usr/gsl/gsl/lib
  1. make安装
cd PennCNV2-1.0.0/
make

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