除了大众化的魔法，还有一些学术型的魔法，它主要起源于两个方面：一个是赫尔墨斯·特里斯墨斯忒斯的著作。另一方面是关于新柏拉图主义的思想。人类被囚禁在肉身之中，却渴望与天界产生联系。在日心说代替了地心说之后，浩渺的宇宙带给人们更大的想象。魔法也从此刻变成了某种新的事物。到了文艺复兴时期，神秘学开始流行。不少魔法师觉得自己是在揭示事物被隐藏的面貌。他们尝试占星学，炼金术以及之后用来治疗疾病的化学方法。魔法也开始随着各自的脉络有了新的发展。
1492年哥伦布到达美洲后不久，瓦斯科达伽马又开始了围绕非洲的航行。欧洲与其他大陆产生了更多的联系，这让他们的魔法也发生了许多改变。在《赫尔墨斯文集》中，这个虚拟的人物对文艺复兴时期的魔法产生了重要的影响。他运用了一些从希腊化时期的埃及留存下来的文献，并且研究了更早期的原始资料。这些著作被后人广泛翻译流传。他的思想也成为了基督教和古希腊哲学精神的起源处。
赫尔墨斯·特里斯墨斯忒斯的作品直接涉及的魔法内容并不多，而是从更广义的层面思考宇宙之间的连接方式，把魔法，哲学和医药方面的诸神介绍给人们，并且运用交感原理作用，将天上永恒的存在与地上的世俗映象对应，让人们有更直观的感受。比如在花卉中的睡莲，白天会开放日落时闭合，公鸡也是清晨打鸣。所以在有阳光温暖这些定义的地方，都可以看到睡莲或者攻击的形象。过去鸡因为可以飞到更高的空中不被束缚，所以被认为是很有力量的。有些地方甚至认为狮子都是害怕攻击的，还把公鸡与太阳联系起来解释。魔法和哲学采用的两种途径都是经验主义的。特定事物与太阳以及太阳之上能量的连接让人们心存敬畏。
炼金术是所有魔法中都会关注的重点。它最早被书面记录下来可以追溯到中古时代的中东文明。在炼金术的发展过程中阿拉伯世界有着重要的贡献，古希腊也是从13世纪起翻译阿拉伯手稿之后才将炼金术传播到欧洲的。其中美索布达米亚埃及之间的跨文化联系，印度和中国可能也有一部分贡献。公元2世纪前后，埃及用希腊语写成的《翠玉集》里提到了如何区分金属的等级，还有就是如何将金属从低等级状态转向高等级。书中提出各种类型的混合物都有，其力量而且可以缓慢地从基础状态逐渐向更完美的状态演变。炼金术并不仅仅从财富层面考量，而是代表了一种一切都会变得更好的宇宙观。在这个发展过程中有一个名为贾比尔·伊本·哈扬的阿拉伯人，在欧洲他的拉丁名为吉贝鲁斯，他发展出的有约束的实验规则，对之后化学发展有着极其重要的意义。
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