for i in ERR*;
do
i=${i}
echo ${i}
cd ${i}
mv ${i}.sra ../
cd ../
done
for i in ERR*;
do
i=${i}
echo ${i}
cd ${i}
mv ${i}.sra ../
cd ../
done
fastq-dump是SRAtoolkit中使用频率很高的命令，用于从SRA文件中拆解提取fastq文件。具体用法...
第一步：用conda 安装 SRA-tools conda install sra-tools 第二步 建立文件夹...
遍历文件夹下文件夹和文件 提取文件名和文件目录 #：表示从左边算起第一个%：表示从右边算起第一个##：表示从左边算...
把layout文件夹拷贝出来 删除整个layout文件夹 在res文件夹上面右键New----directory ...
除了利用ascp命令从NCBI下载SRA文件外，SRAtoolkit也提供了prefetch命令用于下载SRA文件...
除了利用ascp命令从NCBI下载SRA文件外，SRAtoolkit也提供了prefetch命令用于下载SRA文件...
sra和fq 1 sra或fq（fastq），都是测序格式的文件。通俗理解：sra是把双端测序的2个文件合成了1个...
prefetch命令下载SRA 下载单个SRA文件 下载多个SRA文件
一、一般情况下： 转换 .sra 文件成 .fastq/fasta 文件（此步需要在含有文件的文件夹下运行） s...
1.新建Classes文件夹，并在文件夹内把划分好的文件夹结构新建出来 2.
本文标题：2022-11-17 从文件夹把.SRA文件提取出来
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