美文网首页
fsl批处理脚本

fsl批处理脚本

作者: novenine | 来源:发表于2018-08-19 15:24 被阅读0次

具体情况因人而异

#!/bin/bash

#touch processgo.sh

filelist=`ls /root/user/xiangyademo1/control_DTI_mriconvert/`

for dir in ${filelist};do

if [ -d ${dir} ];then

echo $dir

cd ${dir}

name=$(find *.nii)

#echo ${name%.*}

fslroi ${name%.*} b0 0 1

b0=$(find b0.nii.gz)

bet2 $b0 nodif_brain -m -f 0.2

eddy_correct ${name%.*} data 0

bvecs=$(find *_bvecs)

bvals=$(find *_bvals)

dtifit --data=data.nii.gz --out=data --mask=nodif_brain_mask.nii.gz --     bvecs=$bvecs --bvals=$bvals

cd ..

fi

done

相关文章

  • fsl批处理脚本

    具体情况因人而异 #!/bin/bash#touch processgo.shfilelist=`ls /root...

  • 第一节 运用批处理使程序在windows服务器下后台运行

    引言: 批处理(Batch),也称为批处理脚本[https://baike.baidu.com/item/%E8...

  • 关于CMD

    批处理 是一种简化的脚本语言 称作 宏 类似于 Unix中的Shell脚本 批处理 具有.bat或者.cmd的扩展...

  • 向大鱼致敬 (多图)

    Refs 大鱼 (豆瓣) 批处理图片用到的脚本:

  • 打包项目脚本

    1.批处理打包项目(war包) 2.分享一个批处理打war包脚本

  • 批处理脚本

    shell脚本和批处理,通常就是linux和windows下进行的一些简单脚本执行任务的途径。对于linux来说,...

  • Linux Shell 脚本编写学习

    shell脚本 Shell Script,Shell脚本与Windows/Dos下的批处理]相似,也就是用各类命令...

  • 批处理编写入门

    1.1、批处理作用 自上而下成批的处理每一条命令,直到执行最后一条! 一般批处理也叫脚本,如何该脚本实现的破坏功能...

  • FSL-Introduction

    Installation Ubuntu下安装AFNI和FSL 、NeuroDebian-fsl-complete...

  • linux扩展名表示

    *.sh : 脚本戒批处理文件 (scripts),因为批处理文件为使用 shell 写成的,所以扩展名就编成 ....

网友评论

      本文标题:fsl批处理脚本

      本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/vjmciftx.html