limma在输入的归一化之后的表达矩阵,一定要经过log2处理,只有经过log2处理才可以作为输入的表达矩阵,TPM,FPKM等尽量也要归一化处理
计算得出的logFC 本质上就是两个组别的平局值的差值
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分子分母决定权,由levels参数决定,谁在前面谁是分母,如下图,计算的结果就是low-high
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还有一点:两个红框要保持高度统一
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当我们换一个level顺序:
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结果如下:
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