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GSEA的使用

GSEA的使用

作者: expgene | 来源:发表于2023-11-11 18:16 被阅读0次

探序基因肿瘤研究院  整理

GSEA全称是Gene Set Enrichment Analysis

关键词:

Enrichment Score (ES):富集分数

Normalized Enrichment Score (NES):归一化后的富集分数,考虑该基因集的大小,将每个基因集的ES值标准化,得到标准化的富集分数。

如果要了解富集分数的计算方法,参考这篇知乎的文章:知乎-富集分析

Nominal p-value:名义p值,富集分析统计学显著水平

FDR q-value:false discovery rate q-val ,假阳性率P值,多重假设检验后得到的富集分析统计学显著水平

FWER p-Value:familywise-error rate p-val ,总体错误率P值。

参考:

知乎-转录调控 | 基因集富集分析(GSEA)介绍

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