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大位移匹配LDDMM算法

大位移匹配LDDMM算法

作者: 闪电侠悟空 | 来源:发表于2021-08-31 15:02 被阅读0次

文献追踪到这个15年前的文献,被引超过1500多次。旨在解决大位移图像的匹配,将大位移用积分分解的思路惊艳到我了,同时数学公式看到了头大。所以写下,做个记录。

  • Beg, M. Faisal, et al. "Computing large deformation metric mappings via geodesic flows of diffeomorphisms." International journal of computer vision 61.2 (2005): 139-157.

问题描述:

图像I_0, I_1:\Omega\rightarrow \mathbb{R}是个函数。
图像变换,\psi。对函数的操作。记做I_0\circ\psi=I_0(\psi).
微分同胚,diffeomorphic. 这个是个连续变换的概念。[参考逐渐僵化的笑脸]

The large deformation model for computing transformations developed by Christensen overcomes the limitations of the small deformations model by ensuring that the transformations computed between imagery are diffeomorphic.

  • 目标是找到一个变换让图像距离最小


  • 策略是将大变换换成小变换的组合。也就是说,最终的变换是逐渐产生的。



    生成一系列中间变换
  • 最终的数学模型是这样子的,看来也不是很复杂哈。


    问题建模

问题求解。

这下就有点难度了。大致感觉就是用Euler-Lagrange equation走一遍,可是我看不懂。结论是:采用standard gradient descent的算法就完事了。这个欧拉方程推导回头再看看。

通过v求解\psi.

问题

这不就是流体力学中的transport equation吗?两种坐标系,两种解法,拉格朗日法和欧拉法

  • 用拉氏方法,become computations on an unstructured mesh.

  • 欧拉方法, in the Eulerian frame of reference.

  • 时间步长的问题

The issue here is the choice of the size of the timestep.

  • 混合方法 Semi-Lagrangian schemes.
  • 在实际代码中,感觉还是用的简单的拉格朗日方法,cry!

Integrates a vector field via scaling and squaring.

Ref, A Git Repo

总结,除了细节还有点迷糊,大体的方法和手段都基本上可以说是了解了。

扩展

在理解了这个文章的思路后,我发现在PIV测量中还没有这么干的。而PIV中最关注的恰恰是速度量,所以拿过来到PIV中用下,写了个文章Diffeomorphic Particle Image Velocimetry,感兴趣的读者可以去看看效果。

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