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    统计方法

    • 肿瘤纯度计算(InfiniumPurify基于甲基化)
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      2022-12-08
    • 肿瘤纯度计算(InfiniumPurify基于甲基化)概念来源 肿瘤纯度(tumor purity)指的是样本中肿瘤细胞占所有细胞的比例。原始文献Systematic ...[作者空间]

    • 检验正态分布方法的汇总
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      2022-10-30
    • 检验正态分布方法的汇总在数据分析过程中,往往需要数据服从正态分布,正态分布,也称“常态分布”,又名高斯分布,在求二项分布的渐近公式中得到...[作者空间]

    • 如何从TCGA数据库下载体细胞突变数据(somatic muta
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      2022-07-21
    • 如何从TCGA数据库下载体细胞突变数据(somatic muta前面给大家介绍了新版的TCGA数据库,通过文字和视频给大家讲解了如何从TCGA数据库下载RNAseq数据和miRN...[作者空间]

    • 当在谈临床预测模型时候,我们究竟在说啥?
      0
      2022-06-01
    • 当在谈临床预测模型时候,我们究竟在说啥?临床资料收集: 1.提出科学问题 2.收集临床资料 3.选择合适统计学方法 4.选择合适的统计软件 5.评估结果,...[作者空间]

    • RNA 19. SCI 文章中无监督聚类法(ConsensusC
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      2022-04-26
    • RNA 19. SCI 文章中无监督聚类法(ConsensusC 点击关注,桓峰基因 基于RNA数据做临床预测时,我们往往并不知道该对样本怎么分类,那么就需要对肿瘤样本进行分类或...[作者空间]

    • 卡方检验有哪些指标?卡方值怎么计算?
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      2022-05-11
    • 卡方检验有哪些指标?卡方值怎么计算?一、研究场景 卡方检验是一种假设检验的方法,它属于非参数检验的范畴,主要是用于分析定类数据与定类数据之间的关系情况...[作者空间]

    • RSEM的TPM,FPKM,COUNT数据整合
      0
      2022-04-17
    • RSEM的TPM,FPKM,COUNT数据整合RSEM的数据整合只能整合count内容所以简单写了个函数整合RSEM的TPM,FPKM,COUNT[作者空间]

    • Topic 8. 临床预测模型-Lasso回归
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      2022-04-06
    • Topic 8. 临床预测模型-Lasso回归Lasso回归在决定哪些因素可以纳入模型提高模型的稳健性,以及相应的给出各种可用图表,在做生物标志物筛选时,效果非...[作者空间]

    • 【点】模型选择标准:AIC与BIC
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      2021-07-26
    • 【点】模型选择标准:AIC与BIC数据少,模型复杂,过拟合 数据多,训练得好,过拟合 需要标准来平衡,除了常见的正则化,还有其他标准。 1、赤池信息...[作者空间]

    • 10X单细胞(10X空间转录组)降维分析之UMAP
      0
      2021-05-17
    • 10X单细胞(10X空间转录组)降维分析之UMAPhello,大家好,关于降维算法,在之前分享的文章10X单细胞(10X空间转录组)降维分析之tSNE(算法基础知识...[作者空间]

    • 单因素方差分析(One-way Anova)与T检验
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      2021-04-06
    • 单因素方差分析(One-way Anova)与T检验单因素方差分析(One-way Anova)与T检验的用途很类似: 1. 都需要样本数据符合正态分布; 2. 都是...[作者空间]

    • 敏感性和特异性(sensitivity and specific
      0
      2020-11-12
    • 敏感性和特异性(sensitivity and specific敏感性与特异性敏感性和特异性虽然与查准率和查全率相似,但并不相同。其定义如下:在癌症示例中,敏感性和特异性指: 敏...[作者空间]

    • 更新了!多数据集合并及去除批次效应工具使用详解!
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      2020-06-28
    • 更新了!多数据集合并及去除批次效应工具使用详解!01—研究背景 批次效应表示样品在不同批次中处理和测量产生的试验期间记录与任何生物变异无关的技术差异。高通量测序发...[作者空间]

    • 超几何分布检验(hypergeometric test)以及R中
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      2020-06-17
    • 超几何分布检验(hypergeometric test)以及R中超几何分布检验常用来对venn图两个圈overlap的显著性进行检验设总共有29个人,其中11个吸烟者,18个非吸...[作者空间]

    • 如何防止机器学习模型的过拟合(翻译笔记)
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      2020-05-11
    • 如何防止机器学习模型的过拟合(翻译笔记)How to Prevent Overfitting in Machine Learning Models Ver...[作者空间]

    • 如何理解Type I/II Error,敏感性与特异性以及ROC
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      2019-12-16
    • 如何理解Type I/II Error,敏感性与特异性以及ROC(2019-12-16) 首先,Type I/II Error 在维基百科的解释为: Type I error i...[作者空间]

    • 线性回归、岭回归、Lasso回归、ElasticNet回归
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      2018-10-19
    • 线性回归、岭回归、Lasso回归、ElasticNet回归1. 线性回归(Linear Regression) 1.1 简述 在统计学中,线性回归(Linear Regre...[作者空间]

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