1.什么是支持度？ 我们对进化树可信度的估计本身就是一个难题，因为我们没有“已知”祖先序列和系统发育的例子。有几种...[作者空间]
导读 本文将介绍三种使用VCF文件，构建系统发育树的方法，包括程序的安装，使用，已及系统发育树的可视化与美化。 1...[作者空间]
一、NCBI Taxonomy 数据文件 NCBI Taxonomy数据库将所有生物的分类学关系组织为一棵“有根树...[作者空间]
基因流（也称基因迁移）是指从一个物种的一个种群向另一个种群引入新的遗传物质，从而改变群体“基因库”的组成。通过基因...[作者空间]
看到一个可进行物种分歧时间估计的方法，是PAML中的一个子程序mcmctree。在此记录。 标题：PAML 4: ...[作者空间]
第一次体会到文献鸟的好处，给我推送了一篇bioinformatics的文章https://doi.org/10.1...[作者空间]
基本概念： 基因流（也称基因迁移） 是指从一个物种的一个种群向另一个种群引入新的遗传物质，从而改变群体“基因库”的...[作者空间]
横向——覆盖度（coverage） 所谓覆盖度，也可以理解成“有多少基因组区域被覆盖”，一般是一个百分比。比如我们...[作者空间]
-2. 在一篇讲泥炭藓的MBE看到了dfoil的使用 《Extensive Genome-Wide Phyloge...[作者空间]
1. RAxML 简介 RAxML (Random Axelerated Maximum Likelikhood)...[作者空间]
"Github/mmatschiner的phylogenetic & phylogenomic学习教程记录【二】贝...[作者空间]
SFS的基本理解、介绍的一篇文章：https://theg-cat.com/tag/joint-sfs/[http...[作者空间]
基因序列中的密码子随着时间的推移以几乎恒定的比例进行替换，具有恒定的演化速率，因此两个物种时间的遗传距离与物种分歧...[作者空间]
前言 种群历史动态研究常用软件有PSMC、MSMC、SMC++，小编接下来带你安装MSMC 安装所需环境 （一）D...[作者空间]
赤池信息准则（Akaike Information Criterion，AIC）贝叶斯信息准则（Bayesian ...[作者空间]
随机误差随着数据量增加而减少，系统误差随着数据量增大而增大。常见的系统误差包括三种:第一种是序列组成异质性(com...[作者空间]
使用conda创建独立环境进行安装 检查augutus是否可以使用，查看可以使用的物种数据库。 检查Busco是否...[作者空间]
Docker Busco安装 使用此命令可以查看当前docker下有哪些容器可以使用。sudo docker im...[作者空间]
简介 简单多线程快速计算同源基因对kaks 依赖工具 ParaAT2.0 KaKs_Calculator2.0 P...[作者空间]
