缘起：课题组需要组装一批物种的matK、rbcL与ITS分子标记，用于后续的生态学研究。 对于matK、r...[作者空间]
导入一段DNA序列 设置窗口碱基的长度 计算GC含量 计算AT含量 可视化[作者空间]
前段时间，发表了一篇叶绿体基因组比较分析文章。尽管这类套路文已经不再热门，但在准备数据分析的过程中，仍感各种资料教...[作者空间]
DnaSP 6.0计算 系统发育分支的多态位点数( polymorphic sites，S) 单倍型数( the ...[作者空间]
叶绿体基因组Pi分析（Nucleotide diversity） 今天主要分享绘制这一张图需要做的工作。 1. 准...[作者空间]
组装并注释完叶绿体基因组后，就要进行圈图的绘制。这里使用在线网站OGDRAW来绘制圈图。 主要参考教程：叶绿体基因...[作者空间]
【大致阐述一下操作思路，还没实际应用过】 所需软件：bandage所需文件：①fastg文件；②csv文件（这两个...[作者空间]
使用软件：Geneious目的：对组装好的叶绿体基因组进行注释，注释好后进行查看，无误后绘制圈图 【注释部分】 1...[作者空间]
单倍型： 是单倍体[https://baike.sogou.com/lemma/ShowInnerLink.htm...[作者空间]
我这里使用python和biopython，关于python和Biopython的安装可以参考我的B站视频 htt...[作者空间]
背景 orthfinder和直系同源基因介绍 生信基因功能分析工具：Orthofinder使用教程[https:/...[作者空间]
背景 二代测序技术（NGS）的快速发展促使各种有机体的高通量测序数据的累积，特别是细胞器基因组。因此，为了应对各...[作者空间]
