和在基因编码区中的CpG位点不同，在基因正常表达时，位于基因启动子区中的CpG位点往往不会被*甲基化；这种现象表明启动子序列中的CpG位点的甲基化很可能导致基因表达被抑制。DNA甲基化和组蛋白修饰是基因铭印的核心过程[9]。大多数组织间或正常样本和癌症样本间的甲基化差异发生在CpG岛附近（CpG island shores）而非CpG岛内部[10]。
A探针（非甲基化数目） 数目为U
B探针（甲基化数目） 数目为M
beta值为M/(U+M+100)
beta值反应的是能够和给定的被甲基化的序列匹配的寡核苷酸的比率，反应序列中的甲基化率
TCGA下载下来的就是beta值
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