学习小组day1---Iris

作者: Irismengyu | 来源:发表于2018-09-10 21:26 被阅读48次

Part1: 癌症免疫疗法的基础

1.1976年:Hiroshi Shiku博士,Herbert Oettgen博士和LIoyd Old博士
鉴定出肿瘤患者体内天然的抗肿瘤免疫反应
在20世纪70年代,很少有人相信免疫系统对癌症有保护能力。幸运的是,Hiroshi Shiku博士,Herber Oettgen博士和LIold Old博士帮助证明了免疫系统确实在保护人体抵御癌症方面发挥了作用。位于几年斯隆-凯特琳癌症中心(Memorial Sloan Kettering Cancer Center)的这些科学家们表明,黑色素瘤患者血液中的抗体,可以证明黑色素瘤细胞上的抗原并与之反应,这些抗原也能够表征。这是免疫系统能够精确瞄准癌细胞并对其发起反应的首要关键证据之一,并且有助于建立癌症免疫学和免疫治疗的概念基础。

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学习一个安装bioconductor的代码:
source("http://bioconductor.org/biocLite.R"options(BioC_mirror=mirrors.ustc.edubiocLite("CLL")
library(CLL)

读入示例数据

data("CLLbatch")

rma方法进行背景矫正【当MM值比PM值还要高时,MM就是CLLrma<-rma(CLLbatch)

e_before<-exprs(CLLbatch)
e_after<-exprs(CLLrma)

对比一下矫正前后数据

e_before[1:5, 1:5]
e_after[1:5, 1:5]


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