chapter8：conda包安装和测试

本书提供了详细的安装代码，可以直接黏贴，但是在国内conda的安装使用清华源会快很多。
lunix原来已经安装了python，可使用apt-get remove python进行卸载。

curl -OL https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh

bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh

后面也是改用清华源

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/

conda的更新也在添加清华源后进行

下载doctoc.py进行监测，发现报错:

按照要求把路径添加到PATH中

PATH=~/bin:$PATH
export PATH
#重启shell！

配置软件源

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge 
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda 
conda config --set show_channel_urls yes

建立虚拟环境

conda create -n bio python=python3.6  #自己选择环境名和python版本
# 激活环境
conda activate bio

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