2019.10.29
运行genscan在OS65
cd genscan(进入文件）
tar xvf genscanlinux.tar(解压.tar)
./genscan (空运行）看软件路径有没有解压对 能不能运行这个软件
./genscan HumanIso.smat HSU47924.fasta -ps HSU47924.ps >result.txt(结果生成这个文件） 一步输出结果
less result.txt
ps2pdf HSU47924.ps （转化成pdf格式文件）输出文件为HSU47924.pdf ，通过Winscp传输到Windows中。
运行Phrap在Ub17
cd Phrap
tar zxf(xzvf) Phrap64.tar.gz
./Phrap/phrap lesson.seq.screen -minmatch 20 -minscore 40 -view -new_ace
less lesson.seq.screen.contings 看输出结果
contigs:短序列拼接成比较长的序列
2019.10.29 运行genscan在OS65 cd genscan(进入文件） tar xvf gensca...
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当思绪停留处，执笔挥发。 让万千的欲望，止于笔上。 我本乡村少年，未曾见过，紫玉上纸。 如今见了， ...
本文标题：6. genscan、Phrap
本文链接：https://www.haomeiwen.com/subject/lccnvctx.html
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