思维导图
day5思维导图.png
学习要点----R语言重要的两个数据类型
part 1：向量
向量：多个元素组成的变量
理解元素、向量和标量-来自生信星球
几种赋值向量的方法
a <- c(1, 2, 3) #常用的向量定义写法，意为将x定义为由元素1，2，3组成的向量。
a <- (1: 10) #从1-10之间所有的整数
a <- seq(1, 10, by = 0.5) #1-10之间每隔0.5取一个数（注意这里是逗号不是分号）
a <- rep(1: 3, times = 2) #1-3 重复2次
从向量中提取元素
根据元素位置
x[4] #x第4个元素
x[-4] #排除法，除了第4个元素之外剩余的元素
x[2: 4] #第2到4个元素
x[-(2:4)] #除了……
x[c(1, 5)] #第1个和第5个元素
根据值的大小
x[x == 10] #等于10的元素
x[x < 0]
x[x %in% c(1, 2, 5)] #存在于向量c（1，2，5）中的元素
注：x[x %in% c(1, 2, 5)]也可以简单理解为c在x中的真子集。
part 2：数据框
(1)读取本地数据
read.table(file = "huahua.txt",sep = "\t",header =T)
读取文件，分隔符为Tab，有表头
a<-read.table(file = "huahua.txt",sep = "\t",header =T)
把这个数据框赋给一个变量a
（2）设置行名和列名
X<-read.csv('doudou.txt') #在示例数据里有doudou.txt 注意这里的变量X是一个数据框
colnames(X) #查看列名
rownames(X) #查看行名,默认值的行名就是行号，1.2.3.4...
colnames(X)[1]<-"bioplanet"#有的公司返回数据，左上角第一格为空，R会自动补为x,用这个命令来修改
X<-read.csv(file = "huahua.txt",sep = "\t",header =T,row.names=1)#最后row.names的意思是修改第一列为行名
(3)数据框的导出
write.table(X,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F)#分隔符改为逗号，字符串不加双引号（默认格式带由双引号）
（4）变量的保存与重新加载
save.image(file="bioinfoplanet.RData")#保存当前所有变量
save(frame1,file="frame1.RData")#保存其中一个变量
load("frame1.RData")#再次使用RData时的加载命令
保存的格式是RData。
（5）提取元素
X[x,y]#第x行第y列
X[x,]#第x行
X[,y]#第y列
X[y] #第y列
X[a:b]#第a列到第b列
X[c(a,b)]#第a列和第b列
X$列名#也可以提取列
(6)直接使用数据框中的变量
例：提取两列作散点图
c <-data.frame(case=paste("S",c(1:50)),values=runif(50))
> plot(c$case,c$values)
其他方法：
方法一 attach
attach(c)
plot(case,values)
方法二 with
with(c,{
+ plot(case,values)
x<<-summary(values) #求和并赋值给x,<<的意思是作为全局变量，y也就是出了with循环仍有效。
})
x#运行完后打印x
学习体会
Day5的学习着实费劲一些，又生病，真是没爱了。还有两天，争取多学一点，毕竟这几天不用像之前那样天天摸瞎了。
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