导读

这是一篇来自Briefings in Bioinformatics 2018的综述。该综述比较了宏基因组宏转录组分析的所有方法，值得参考。

文献：Bioinformatics tools for quantitative and functional metagenome and metatranscriptome data analysis in microbes. Brief Bioinform. 2018

一、16S rRNA扩增子工具比较

二、宏基因组分类分析工具比较：种水平

三、宏基因组分类分析工具比较：株水平

四、宏转录组分析工具比较

宏基因组 + 宏转录组工具盘点比较
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宏基因组 + 宏转录组分析工具：HUMAnN
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盘点宏转录组分析方法
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4、RNAseq(4)--Hisat2进行序列比对及Samtoo
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转录组测序技术和结果解读（五）——参考基因组mapping
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转录组学习二（数据下载）
转录组学习一（软件安装）转录组学习二（数据下载）转录组学习三（数据质控）转录组学习四（参考基因组及gt...