Verkko是一款能够对HiFi和ONT数据进行混装的工具，是一款可以用于T2T组装的工具。
1 Verkko安装比较简单，利用conda可直接安装
conda install -c conda-forge -c bioconda -c defaults verkko
2 安装好之后就可以直接运行程序啦！
这里我测试了只用HiFi数据进行组装
nohup verkko -d verrkko/ --hifi HiF_reads.fastq.gz --no-nano --threads 80 --local-cpus 80 --local-memory 120
-d 结果输出目录
--hifi hifi reads位置
3 结果
最终会生成下面几个文件
组装结果为assembly.fasta文件
对组装结果进行统计，N50结果并不是很好，没有hifiasm组装效果好，耗时也比hifiasm长。
可能是没有加入ONT数据，导致组装结果不是太好。
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本文标题：利用Verkko组装基因
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