window下使用xtb转换二维sdf文件
教程参考官方
https://github.com/grimme-lab/xtb_docs/blob/main/source/gfnff.rst#d-to-3d-structure-converter
下载xtb version 6.7.1
https://github.com/grimme-lab/xtb/releases/tag/v6.7.1
解压到文件夹（我的地址不含中文）
打开文件夹
xtb-6.7.1/bin
在该文件夹右键打开powershell，输入命令
其中Structure2D_COMPOUND_CID_16201712.sdf 是你丢进去的文件
.\xtb.exe Structure2D_COMPOUND_CID_16201712.sdf --gfn 2 --sp
为了方便可以添加bin文件夹到path，这里懒得搞了
＃如何识别PDB文件中的特定氨基酸残基 1.PDB文件格式 pdb文件说明： 2. python3版本 3. py...
1. 根据PDB ID在PDB数据库下载pdb文件 PDB官网：http://www.rcsb.org/ 这里的1...
步骤： 1.扫描二维码 https://pan.baidu.com/s/1c1SdF7i 下载练习文件； 2.新建...
数字电路门级仿真及SDF[https://so.csdn.net/so/search?q=SDF&spm=1001...
windows下的调试文件pdb
python -m pdb xxx.py 第二种方式：在py文件中import pdb 在要加断点的地方pdb....
Mono中调试使用的不是pdb文件，而是mdb文件，所以先要下载插件pdb2mdb.exe。 下载步骤：VS-->...
Biopython 第十一章:走向3D:PDB模块 PDBParser和MMCIFParser PDBParser...
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asdfasdfsdaf sdf sdf sdf sadf sadfsad dfasdf dsf sdf sdf
本文标题：二维 sdf 文件转3d PDB
本文链接：https://www.haomeiwen.com/subject/sssirjtx.html
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