19世纪时，查尔斯・达尔文（Charles Darwin）提出了进化论，解答了"我从哪里来?"这一个根本性的问题，直至今日，进化论依然是我们生物学的基础。
进化论指生物的变化是自然选择和随机的基因突变共同作用所得的结果，随着时间的推移，适者生存，不适者淘汰。由单细胞开始，变成微生物，再变成海洋生物，变成两栖类动物，再出现了爬行动物，再进化成鸟，最后哺乳类动物。 就成了今天的你和我，还有他、她和它。
我们每一代都是这样教育下来的，但进化论是达尔文构想出来的，还是经过科学所论证出来的？
根据进化论，我们和其他生物之间所诞生的时间差距应该数以千万年计。 倘若海洋生物是我们的祖先，为什么他们经历千万年还没进化出智慧？只有后来的人类却居上生物链的榜首？若果后来出现的是进化版，为什么还没有出现更进阶版的"人类"？
2018年《人类演化》（HumanEvolution） 中出现一份由纽约洛克斐勒大学（Rockefeller University）基因专家史托克尔（Mark Stoeckle）所发表的研究报告（Sweeping gene survey reveals new facets of evolution），当中指出全球76亿人、5亿只家麻雀或10万只鹬科鸟类的基因多样性「大致相同」。也就是说，全地球上90%的生物，都是在10-20万年间出现。 这和进化论有直接的矛盾。
多年来，一直有人提出，如果进化论成立，那为什么我们找不到进化中的过渡生物呢？若果人类的祖先是猿猴，那我们为什么找不到一些猴身人手，或猴身人脚，又或者人头猴身的过渡性生物呢？ 哈佛大学生物学家斯蒂芬・杰伊・古尔德（Stephen Jay Gould）一直都是进化论的拥护者，他后来也无奈承认过渡形态的化石微乎其微。科学家称之为"缺失的一环"。
缺失的一环不仅仅出现在动物上，科学家们一直致力找出不开花的植物是怎样进化成开花植物，百多年过后，依然徒劳无功。我们找到3亿年前不开花的植物化石，亦找到1亿年前至今的开花植物，但却找不到两者之间的中间种。 达尔文把这个缺失称之为"讨厌的谜题"，他曾经承认这是一个很严重的问题，并足以推翻整个理论。
根据进化论适者生存的原则，生物都是汰弱留强，留下的必定比上一品种更为优胜，所谓的优胜，主要以繁殖能为重。那么无性繁殖的不开花植物，为什么突然会长出有性繁殖的开花组织呢？
进化论的支持者指出，新品种的诞生是因为基因的突变。但基因的突变通常只会出现在个别生物上，又如何演变成一整个品种呢？ 倘若不开花的植物，因为基因突变，突然长出了花。没有昆虫或动物去传播花粉，因为在这之前，根本没有花朵，它又怎么可以繁殖下去？那到底是先有蜜蜂？还是先有花？
长颈鹿亦是另一个解不开的谜团，长颈鹿的脖子为什么长这么长呢？
进化论说，因为较低的草和树叶被吃光了，为了生存，所以长颈鹿的脖子越长越长，这样才可以吃到较高的叶子。如果这个说法成立，那么同时期的草食性动物都应该拥有长脖子才对。既然其他的牛羊马都能生存下来，那就代表它们还是能找到足够的食物。
有人说长颈鹿是因为逃避捕猎者的追杀，需要逃跑得快才能保命，不断跑不断跑，腿就长了。腿长了以后，就喝不到地下的水，所以脖子就长长了。首先，跑得快，腿就一定长吗？ 那为什么狮子、老虎和豹等，又没有出现同样的变化呢？如果腿变长了，脖子变长了，那不是更容易被猎食者发现吗？那不就和初衷背道而驰了吗？
有人说，这不是一下子变的，腿先变长一点点，脖子长一点，腿再长一点，脖子又再长一点，这样一步一步慢慢演变而成的。如果是这样，那长颈鹿的进化是一个非常缓慢的过程，但为什么也没有找到过渡品种的化石？
而且，长颈鹿的构造亦不仅仅是腿和颈，它还需要肌肉、心脏和血压等等各方面的配合。 脖子这么长，要供血液给大脑，不但需要强壮的心脏，还要有很高的血压。在这么高血压的情况下，如果长颈鹿低头，它应该立刻爆血管才对，为什么它的头还可以活动自如呢？到底先有肌肉，还是先有强壮的心脏？先长腿，还是先长劲？
进化论是一个结果论，汰弱留强，如果不用的就会慢慢退化，用的就会越来越强大起来。人类大脑中95%都还没开发，为什么它还存在呢？白眼球也没有作用，为什么还存在呢？ 你看，外星人都没有白眼球。如果我们需要衣物去保温，那我们为什么不像猫狗一样全身长毛呢？
到底，我们是进化而来？还是被设计出来？
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