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从ensembel下载基因注释信息

从ensembel下载基因注释信息

作者: 医科研 | 来源:发表于2019-03-22 18:13 被阅读23次
  1. 进入ensembel官网https://asia.ensembl.org/index.html
    image.png

  2. 选择ensembel gene


    image.png

  3. 选择human


    image.png
    image.png

  4. 筛选感兴趣的 biotype-protein coding gene


    image.png

  5. count计算-results-unique去除重复值


    image.png

ENSG-lncRNA分类

前面操作同mRNA, 仅需要选择 lncRNA 的各种分类：ensembl help，包括如下种类：

• 3prime overlapping ncrna,

• ambiguous orf,

• antisense,

• antisense RNA,

• lincRNA,

• ncrna host,

• processed transcript,

• sense intronic,

• sense overlapping

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