PGA: a software package for rapid, accurate, and flexible batch annotation of plastomes
2019年
Plant Methods 4.269 大类分区生物2区
完成单位：中科院昆明植物所
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CPGAVAS2, an intergrated plastome sequence annotator and analyzer
2019年
Nucleic Acids Research 11.56 生物大类1区
完成单位：中国医学科学院药用植物研究所
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中国医学科学院药用植物研究所刘昶课题组在叶绿体基因组注释新算法取得进展
一定要花时间读这两篇论文，学习注释软件的使用方法！
叶绿体基因组注释的比较新的工具还有GeSeq和AGORA等
第一篇 PGA: a software package for rapid, accurate, and flex...
使用软件：Geneious目的：对组装好的叶绿体基因组进行注释，注释好后进行查看，无误后绘制圈图 【注释部分】 1...
组装并注释完叶绿体基因组后，就要进行圈图的绘制。这里使用在线网站OGDRAW来绘制圈图。 主要参考教程：叶绿体基因...
关键词：叶绿体基因组、质体基因组、NCBI、blast 1. 利用注释信息可视化截取+blast比对 建议使用Ge...
本文中使用到的数据是 文献笔记三十五：水稻细胞器基因组数据做群体遗传学分析 文章中提到的水稻叶绿体的那篇论文中提供...
叶绿体基因组类的文章通常会有一幅图来展示叶绿体基因组的相似性（Sequence identity plot），出图...
第一步：根据叶绿体基因组的genbank注释文件获得蛋白编码基因序列 提取序列的python脚本 使用方法pyth...
论文题目 The landscape of chloroplast genome assembly tools 还...
基因组注释（Genome annotation） 基因组注释是利用生物信息学方法和工具，对基因组所有基因的生物学功...
很多人会使用PGA进行叶绿体基因组注释，但是PGA产生的genbank文件不够规范，对其进行以下修改，能解决很多问题：
本文标题：文献笔记三十四：两款新的叶绿体基因组注释工具
本文链接：https://www.haomeiwen.com/subject/zzcexctx.html
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